O ile leczenie endodontyczne pod mikroskopem jest zazwyczaj całkowicie precyzyjnym zabiegiem, czasami w wyniku rozwijających zmian chorobowych nieuniknione jest powtórne leczenie endodontyczne . W większości przypadków najlepiej zdecydować się na próbę zachowania naturalnego zęba. Usunięcie zęba skutkuje pojawieniem się niekomfortowej luki, jaką trzeba wypełnić nie tylko z uwagi na piękno uzębienia. Luka wywołuje stopniowy zanik kości, a nawet prowadzi do ruszania się przyległych i przeciwstawnych zębów, którym brakuje odpowiedniego oparcia. Ponadto wypełnienie luki zębowej skutkuje dodatkowym kosztem w postaci uzupełnienia protetycznego. Niezależnie od tego, czy wybierzemy implant stomatologiczny czy na przykład most protetyczny, oznacza to następne wizyty w gabinecie stomatologicznym i dalsze leczenie.

Dlatego nawet gdy dany ząb był już leczony kanałowo uprzednio, warto rozważyć ponowne leczenie endodontyczne. Choć ponowny zabieg, może być bardziej skomplikowany niż wcześniejszy, wyspecjalizowany lekarz endodonta, zrobi co w jego mocy, aby przeprowadzić leczenie prawidłowo. Wznowione leczenie kanałowe przeprowadza się zazwyczaj, jeśli pojawią się kanały niedoleczone za pierwszym razem, ponieważ na przykład nie były wtedy zauważone. Reakcja lekarza endodonty potrzebna jest w przypadku perforacji komory albo korzenia zęba i jeżeli w kanale utkwiło narzędzie dentystyczne. Usunięcie zęba zwykle następuje tylko wtedy, jeśli nie ma możliwości właściwego dotarcia do kanału.